本校は、竹富島は石垣島の南西約６㎞の海上に盆を伏せたように浮かぶ周囲約９㎞の隆起珊瑚礁からなる人口３６０名余の竹富島にある。三つの集落の中央に位置する学校は小学校で創立125年、中学校は68年目を迎える。児童数が２３名、生徒数１５名の小中併置校である。島には高等学校がなく、中学校卒業後はほぼ全員が親元を離れ島から巣立っていくため、多様な人間関係の中で自己実現を図らなければならない。そのためにも、学力向上を柱に、主体的・創造的に生き抜く児童生徒の育成に力を入れている。また、豊かな体験活動を通しうつぐみの心でうるおいとぬくもりと躍動感のある学校づくりに取り組んでいる。
《特色ある取り組みとして》
○複式授業解消の取り組み
☆中学校教諭による小学生への授業支援
小４年：理科、小３・４年：図工、小６年：算数・理科、小５・６年：音楽・家庭科
○一事徹底（あいさつ・黙働）
「立ち止まってあいさつ」「黙働清掃で心を磨く」
○学校・家庭・地域が一体となって「うつぐみの心」を育む特色ある教育活動を推進
「家庭でしつけ」「学校で教え」「地域で育てる」
☆地域の伝統文化（種子取祭等）の体験と伝承を図る。