4月16日、2度の地震が八重山で起こっている。まず午前10時11分頃地震があり、震源地は石垣島北西沖（北緯25.2度、東経124.0度）で震源の深さは約140km、地震の規模（マグニチュード）は5.7と推定される。震度２は石垣市登野城 石垣市新栄町、石垣市美崎町、竹富町大原、竹富町黒島、竹富町船浮、竹富町上原、宮古では、多良間村塩川、多良間村仲筋、宮古島市平良西仲宗根、宮古島市城辺福北、宮古島市平良池間、宮古島市平良狩俣、宮古島市城辺福西。なお震度１は、石垣市新川、石垣市伊原間、竹富町波照間で、宮古や久米島、座間味島、伊良部島や宮古島市平良西里で記録されている。このあと、22時40分頃にも地震があった。（平成23年04月16日22時45分 気象庁発表）震源地は与那国島近海（北緯24.0度、東経122.8度）で震源の深さは約20km、地震の規模（マグニチュード）は4.6と推定される。各地の震度は竹富町船浮で震度１。１７７１年4月24日に明和の大津波を経験する八重山であれば、東日本大震災は人ごとではない。八重山郡民4万８０００人は、一日２度の地震に紛れなく不安を抱いたはず。
